Крайне неприятная но увы возможная ситуация:
Оборотка за период выдает одни цифры, а карточка того же счета совсем другую. Если у вас база в файловом варианте попробуйте запустить базу в режиме конфигуратора и включите "Тестирование и исправление базы данных". Разумеется перед этим надо сделать копию базы. В зависимости от размеров базы процесс может занять несколько часов.
Если у вас SQL вариант причина может крыться в наличии проводок оторванных от операции. Запустите скрипт
select * from _1SEntry
where DOCID not in (select DOCID from _1SOper)
Получите список проводок оторванных от операций. Удаляем их и по новой перестраиваем итоги. Велика вероятность что ошибка уйдет.